Autoritățile fiscale au acordat o atenție sporită utilizării fondurilor primite de ONG-uri, în special cele din sponsorizări sau redirecționarea unor procente din impozite, efectele verificărilor fiind diferite asupra sponsorilor și ONG-urilor.

Problemele frecvent întâlnite includ aplicarea greșită a conceptului de persoane afiliate, dificultăți în trasabilitatea exactă a fondurilor și cereri nejustificate de justificare a utilizării finanțărilor pe sponsorizare anume.

Pentru a evita sancțiunile, ONG-urile trebuie să documenteze riguros alocarea fondurilor, să dețină contracte clare și să fie conștiente de riscurile fiscal-contabile privind relațiile cu sponsorii și gestionarea internă a banilor.